樓主的顯卡有另外輸出到別的裝置上嗎?
小弟的顯卡有輸出mini dp，還有另外輸出hdmi，但是hdmi那邊平時是待機狀態
只要dp這邊螢幕一關，系統會自動把待機的hdmi那邊設成主螢幕
解析度也一併改變為hdmi那端的最大解析度(較小)
桌面圖示也是會重排，放大(因為解析度變低)
看起來就像樓主形容的那個樣子

後來把多部顯示器那個設定改成同步顯示之後就解決了
(兩邊螢幕可以各自維持自己的最大解析度)
dp這邊怎麼開關系統都不會切換主螢幕了