核電廠除役回饋金法制化，需要提撥給居民的錢都要由核能後端營運基金彌補。根據台電精算，目前基金缺口高達1700億。經濟部表示，核後端基金提撥今年已改為「年金制」，規畫從電價回收填補。目前因委員對台電計算的4728億數字仍有疑慮，尚未開始撥補。

核後端基金是用在核電廠拆廠，用過核燃料運輸、中期貯存與最終處置場設置，每年是由台電依核能發電度數，以每度0.34元提撥到基金內存放，基金規模累積最新為3000億左右。但面臨三座核電廠除役、回饋金提撥、蘭嶼遷移核廢料、物價上漲因素，台電重估經費後經費拉高到4728億，不足缺口高達1700億。