法條都不看也在跟人廢話一堆。

第 53 條
中央流行疫情指揮中心成立期間，指揮官基於防疫之必要，得指示中央主
管機關彈性調整第三十九條、第四十四條及第五十條之處置措施。
前項期間，各級政府機關得依指揮官之指示，指定或徵用公、私立醫療機
構或公共場所，設立檢疫或隔離場所，並得徵調相關人員協助防治工作；
必要時，得協調國防部指定國軍醫院支援。對於因指定、徵用、徵調或接
受隔離檢疫者所受之損失，給予相當之補償。
前項指定、徵用、徵調、接受隔離檢疫之作業程序、補償方式及其他應遵
行事項之辦法，由中央主管機關定之。

也就是檢疫作業程序，中央主管機關就可以直接指定，這是法律授權的。