員工如為僱主之目的執行職務而支領之加班費不超過規定標準者，可免納所得稅；但加班費如超過規定標準的話，超過部分要列入薪資所得，合併申報綜合所得稅。但有的公司是不管有無加班或加班時數多少，一律按月定額發給加班費，則其性質是屬於津貼性質，應併同薪資所得扣繳稅款，不得適用免稅的規定。