2005年 水爆也已併入兩棲偵搜大隊


偵搜大隊目前編制共有七個中隊，分別如下
（括弧內是精實案前分別所屬國軍特種單位，現已不存）

偵搜一中隊（原陸戰66、99師直屬偵搜連）
偵搜二中隊（原陸戰特勤隊）
偵搜三中隊（原海軍陸戰隊政治作戰第九連 俗稱政戰連第9連）
特勤一中隊（原陸戰特勤隊裁編後復編）
特勤二中隊（原陸戰特勤隊裁編後復編）
水中爆破中隊（原海軍水中爆破大隊）
支援中隊（原兩棲偵搜營編制）