舉例來說
原生3.0就像是貨運公司自己有台十噸貨車去目的地載東西
東西載回來就可以直接入倉

非原生3.0就像從貨運集中站載別人家十噸貨車載來的東西
中間必須經過一些手續/溝通動作才能把東西載回來

原生的介面在使用上不需要經過太多東西，多半都是CPU下命令給晶片組就好
非原生的介面在晶片組收到命令後，還需要跟外掛IC通訊才能使用
效能會因為多個步驟而略遜一點

另外還有種(可能性不高的)情況
就是你雖然有十噸貨車，可是道路不允許開大車
所以你只能開五噸以下的車去載貨的情況...

這就還要扯到晶片組給介面的通道大小了....
(我不想講這個，留給別人講了XD)