軌道配置不允許，古亭站南邊只有從中和線過度到新店線的單橫渡線，沒有能讓新店線列車過度到中和線的雙橫渡線或剪式橫渡線。硬要這樣走，除非新店線列車進古亭站以後，再倒退走橫渡線進中和線後進古亭站的中和線月台。而這樣對行車安全與班距都會造成極大的障礙。
另外，未來松山線完工通車後，新店線也會改接松山線，不再進台北車站。
順便強調一點，捷運是"大眾運輸交通工具"，不是"私人載具"。