速度上不會有差的，IDE模式下的SATA硬碟，
爆發速度也可以衝到200Mb/s以上去，
只要硬碟跟控制器都支援300Mb/s的速度就好。

而設定成RAID或AHCI，目的是要用其他功能，
例如RAID是要組磁碟陣列；AHCI是要用NCQ等，
或其他依晶片組不同，還可能提供不同的功能。

主機板方面，小弟遇過早期的SATA，沒得選，
SATA enable只有RAID模式；而現在沒得選的，
應該都是IDE模式
所以還是請您把您想用的硬體說出來，
這樣版上的各位比較好幫您。