那確實是微軟故意的，除非另外用抽取式硬碟盒去處理開機順序的問題，直接讓另外一顆硬碟裡面的系統不會被偵測到，不然從 Win8 開始就已經會砍掉其他硬碟裡面的系統磁區，也就是說只要出現二顆硬碟裡面都有系統，Win8 就一定會幹掉另外一個，以下是我之前發過的文章...

Win8 的超級流氓行為？

Win8 發現 Linux 系統就會屏蔽掉該磁區，開機之後再也看不到了，Linux 系統磁區和 SWAP 磁區都不見了，而且連 XP 系統磁區也都被幹掉，以上都是和 Win8 不同顆硬碟上的系統喔！Win8 單獨安裝在一顆硬碟上。

Win8 會說發現硬碟有問題，問要不要修復？選《否》，結果下一次開機忘記把那顆硬碟拔掉，在沒有同意的狀況下直接就開始對另外那顆有其他系統的硬碟修復，就是把磁區屏蔽掉，然後就看不到那些磁區的任何檔案了。:jolin:

另外一點，只要有安裝 Win8 系統的那顆硬碟，曾經被設定為第一開機順序就完蛋了，就算是再次設定回來光碟機、可開機的隨身碟救援系統等等...為第一順順序也沒用，完全不理你，開機掃一下瞬間就直接跳過。 :stupefy:

除了拔掉電池之外無解！ :flash:

被幹掉 3 個不同版本的 Linux，幹掉 2 個 XP 系統，全部都是和那顆 Win8 是不同硬碟的，只是同在一台主機上就倒楣了。

以上試驗過二台不同的 INTEL 主機上都發生同樣的事情，在 ubuntu 的討論區，之前只是討論到不能在已經安裝 Win8 的系統之後，然後接著安裝 Linux 會失敗而已，還沒有發現 Win8 居然會砍掉別的系統，微軟這樣直接幹掉別人的系統，真的不會觸犯反托拉斯？ :tu:

而且以上都是發生在傳統 BIOS 的主機板，要是有 UEFI 的可能還更慘。

最慘的是筆電，要是一旦把 Win8 那顆硬碟曾經被設定為第一開機順序，萬一發生問題要救援資料的時候，光碟機(放入可開機的光碟片)和可開機的 USB 隨身碟都不理你，偏偏筆電的主機板電池除非拆解筆電根本就看不到(少數機種可以直接換電池不用拆機)，那等於是一定要拔硬碟到別台電腦去救援資料了。 :think:

PS.
後來有試驗過 Win7-SP1 的系統碟，也是一樣被 Win8 幹掉，所以微軟從 Win8 開始就是只容許一顆系統硬碟，只要發現其他的硬碟裡面有系統，那個磁區(槽) 就會被幹掉。 :stupefy:

關掉快速啟動後開機速度要二倍多的時間，用SSD當系統碟雖可快一點，但用一個SSD失掉雙系統意義(和不換硬碟開機同義)，用二個可能又出現同樣問題，看樣子還是回到WIN7，等到WIN7不行了就和Micsoft說再見了。

我是從Win7 直接升到Win10, 所以不知道Win8/8.1 有多難搞 !

不過當初為了保險起見, 我是在保留Win7 的狀況下安裝Win10 做多重開機的, 跟你的狀況有些像, 可能差別在我是Win10 跟Win 7 各一顆硬碟，不過我不是在Bios 中切換開機順序，我是直接用Ｗin10 的BootMgr 切換的，用UEFI 跟關閉快速啟動的狀況下同時並存測試過10天左右，使用上也沒遇到類似你的問題.

不過比較麻煩的是這樣子我這個全新安裝的Win10 就沒有啟用, 我還得把Win 7 那顆自動升級成Win10 取得授權, 再重新安裝一次Win10 來啟用就是了.

就微軟的說法,多重開機有兩種方式,我是用連結第一種,你要不要參考看看？
不過你是兩個系統都要是Win10, 可能真的是不行了?



http://windows.microsoft.com/zh-tw/...t#1TC=windows-7

https://support.microsoft.com/zh-tw/kb/2733250

感謝inlemar提供的經驗，我們狀況非常相像都是把WIN10安裝在不同硬碟，BIOS也是UEFI，目前是開機時會像插入USB似的出現選單，如果執行不做任何動作就不會檢查硬碟，但有時候是在工作列上出現類似DOS作業狀態的訊息8秒內沒按下任意鍵就開始檢查磁碟，那就慘了。
我在想如果有高人能寫一個批次檔開機時會自動回復不做任何動作的訊息應可解決。
Bootmgr要怎麼寫？能指導一下嗎？

我也是 win7 升 win10。
舊硬碟 BIOS + MBR + win7，
新SSD UEFI + GPT + win10，
用 BIOS 切換。
關掉 fastboot 後目前沒大問題。

這個Script 可能得要看看有沒人高人站友能幫上忙, 不過我可以再提供一些資訊給你參考.

我當初用的這種設法是用Windows 內建的開機引導管理, 所以沒用到第三方工具. 也不需要用BIOS 來切換開機順序, 就是有點像早期那種BootManager綁在一起的方式. 像是下面圖片那樣. 跟你目前用BIOS 做開機切換的方式還是有一些不同.

另外我當初是用UEFI 安裝Win 10, 記得我有把ASUS VII Hero 的UEFI BIOS的”Secure Boot" 關掉,還有開機順序的設定不是像以前那樣直接選硬碟代號，是選一個 "Windows Boot Manager+硬碟代號". 你也可以參考你的UEFI BIOS看看.

另外針對BootMgr 的部分,你可以google 看看一個Bootice, 這個第三方的開機導引還蠻好用的喔. 以前灌Linux+Windows 的時候還蠻常用的, 不過爆肝工作久了失去不少玩電腦的熱情,資訊也落後不少, 所以不敢幫你亂出主意了. :nonono:

跟樓主的情況不一樣，我只有一顆硬碟上分成2個磁區，WIN10 跟WIN7都用MBR的模式，用SPFDISK建立多重開機選單，進系統後會隱藏另一個磁區，資料的話是放另一顆硬碟共用...

我沒發生說

而且我是3系統

Win10 /OSX /Linux

打算在EFI區弄個XP

我win8用UEFI開機 win7用CSM開機 就沒事了

記得以前安裝系統時如果已經有作業系統存在，它會自動產生一個開機選單，不管是一個硬碟裝二個系統還是不同硬碟，現在我的麻煩是二顆硬碟系統是獨立的上面各灌了很多軟體，如果要用內建自動產生選單有一顆硬碟要重灌，那工程就大了而且不敢保證就可相安無事，拿掉快速啟動開機時間要二倍多，只能說微軟真是TMD。